Nachdem jugendliche Straftäter bis dahin wie Erwachsene behandelt worden waren, wurde das Gefängnis in Ebrach vor über 60 Jahren in eine Jugendstrafanstalt umgewandelt. Ebrach ist seitdem die größte der drei bayerischen Jugendjustizvollzugsanstalten und für die nach Jugendstrafrecht verurteilten ganz schweren Fälle aus dem Freistaat zuständig, vom Mörder über den Vergewaltiger bis zum Drogendealer. Das Durchschnittsalter liegt bei 20 bis 21 Jahren. Das Besondere am Strafvollzug in Ebrach ist, dass er in einem alten Kloster stattfindet. Dessen Nutzung als Gefängnis hat indes viel früher begonnen.
Ebrach